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Cristalizacion en Gel de Silice para Obtencion de Estruvita
Cristalizacion en Gel de Silice para Obtencion de Estruvita
FACULTAD DE QUÍMICA
Química Física
i
3.5 Preparación de las muestras para las distintas técnicas de caracterización. ............................. 14
3.5.1 Difracción Rayos X monocristal ........................................................................................... 14
3.5.2 Microscopía electrónica de barrido .................................................................................... 14
3.5.3 Microanálisis por dispersión de energía de Rayos X ........................................................... 15
3.5.4 Difracción Rayos X en polvo ................................................................................................ 15
3.5.5 Termogravimetría ............................................................................................................... 15
4 Resultados y discusión ....................................................................................................................... 16
4.1 Resultados de cristalización ........................................................................................................ 16
4.1.1 Cristalización en función de la concentración de solventes y el pH ................................... 16
4.1.2 Cristalización con la adición de iones arseniato. ................................................................ 18
4.2 Difracción Rayos X monocristal................................................................................................... 19
4.2.1 Cristalización en función de la concentración de solventes y el pH ................................... 19
4.2.2 Cristalización con la adición de iones arseniato. ................................................................ 21
4.3 Microscopía electrónica de barrido y microanálisis ................................................................... 22
4.3.1 Cristalización en función de la concentración de solventes y el pH ................................... 22
4.3.2 Cristalización con la adición de iones arseniato. ................................................................ 23
4.4 Difracción de rayos X en polvo.................................................................................................... 24
4.5 Termogravimetría ....................................................................................................................... 24
4.6 Precipitación por el método convencional ................................................................................. 25
4.6.1 Difracción Rayos X en polvo ................................................................................................ 25
4.6.2 Difracción Rayos X monocristal ........................................................................................... 26
4.6.3 Termogravimetría ............................................................................................................... 26
5 Conclusiones....................................................................................................................................... 28
6 Bibliografía ......................................................................................................................................... 29
6.1 Artículos, Revisiones, Libros y Monografías ............................................................................... 29
6.2 Recursos WEB ............................................................................................................................. 30
7 Anexo 1: Difracción rayos X monocristal estruvita ............................................................................ 31
8 Anexo 2: Difracción rayos X monocristal estruvita: archivo checkCIF ............................................... 32
9 Anexo 3: Difracción rayos X monocristal fosfato de magnesio. ......................................................... 34
10 Anexo 4: Difracción rayos X monocristal fosfato de magnesio. checkCIF.......................................... 35
ii
1 OBJETIVO
La cristalización en geles es una técnica de crecimiento en solución mediante reacción química
cuya único mecanismo de transporte de masa es la difusión. El objetivo general de este trabajo
está enmarcado en el estudio de la cristalización de estruvita utilizando un gel de sílice, bajo
diferentes condiciones de trabajo y el análisis la composición química y la morfología de los
cristales obtenidos.
La investigación realizada tiene los siguientes objetivos específicos:
-El proceso de cristalización se llevará, por tanto, variando las condiciones de trabajo, con el
objetivo de estudiar el efecto del pH en la morfología y tamaño de los cristales, cuya morfología
y composición química se estudiarán mediante la Microscopía Electrónica de Barrido (SEM).
-Realizar la reacción de precipitación por método convencional para comparar la morfología del
producto obtenido con los cristales obtenidos en el gel.
-Evaluar cómo afecta la presencia de diversos iones en el gel puede jugar un papel fundamental,
ya que pueden favorecer la estabilización de distintas morfologías que pueden suceder en la
precipitación.
- Caracterizar y comparar todas las fases obtenidas mediante difracción de Rayos X en polvo y
monocristal, y análisis térmico.
PALABRAS CLAVE:
Estruvita, cristal, cristalización en gel, difracción Rayos X, Microscopía Electrónica de Barrido
1
2 FUNDAMENTOS TEÓRICOS
2.1 LA ESTRUVITA
La estruvita es un mineral que pertenece al grupo de los ortofosfatos, de composición química
NH4MgPO4·6H2O, también conocido como fosfato de magnesio y amonio, y ocasionalmente, por
MAP (“magnesium ammonium phosphate”). Se trata de una sal doble de magnesio y amonio.
La estruvita es un sólido blanco que precipita en una relación molar 1:1:1, mediante la siguiente
reacción:
Figura 1: Diferentes morfologías de cristales de estruvita: (a, b) tipo prismático, (c) tipo piramidal,
(d) tipo estrella, (e) tipo plaqueta rectangular, (f) forma de caja, (g) tipo aguja, (h) tipo dendrita
con forma de pluma y (i) tipo dendrita en forma de aspa.
2
La estruvita es térmicamente estable a temperaturas inferiores a 50°C. Cuando el compuesto
pierde cinco de sus moléculas de agua se transforma en un material monohidratado que recibe
el nombre de dittmarita. (3)
3
2.1.3 Influencia del pH en la formación de estruvita
La formación de piedras requiere una orina supersaturada, que depende del pH, la fuerza iónica,
la concentración de soluto y las complejaciones. Estas tres condiciones deben coexistir en la
formación de cálculo de la estruvita: orina alcalina, presencia de urea y amonio en la orina y alta
concentraciones de mineral en la orina. La reacción catalizada por la ureasa produce amonio y
carbamato, como se ha mencionado anteriormente. La formación de cationes amonio produce
un aumento del pH, por lo que, consecuentemente, la orina adquiere un pH neutro o alcalino.
Un elevado pH urinario reduce la solubilidad del fosfato de magnesio y amonio, produciendo la
precipitación de los cristales de estruvita. (8)
Por lo tanto, la precipitación de la estruvita tendrá lugar a pH básicos. Se considera un pH óptimo
para la formación de la estruvita aquel comprendido entre 8-9, ya que la estruvita se podría
disolver rápidamente a pH inferior a 5.5. (1)
4
2.3 CRISTALIZACIÓN EN GELES
El crecimiento de cristales en geles ha recibido importancia desde Liesegang (1896), quien
observó por primera vez la precipitación de sales ligeramente solubles en gelatina. El método
tiene las siguientes ventajas:
5
La reacción que se lleva a cabo para la formación del gel de sílice es la siguiente:
𝑛𝐻2 𝑂
𝑁𝑎2 𝑂 · 𝑆𝑖𝑂2 + 𝐻2 𝑆𝑂4 → 𝑁𝑎2 𝑆𝑂4 + 𝑆𝑖𝑂2 · 𝑛𝐻2 𝑂 (2)
Las desventajas del tubo de ensayo y el tubo en forma de U incluyen el agotamiento de uno de
los reactivos que esté dentro del gel, la incorporación de los productos de desecho de la reacción,
el soporte, la manipulación y la limpieza del aparato; y la preparación del gel dentro del tubo.
La mejora del diseño elimina todos estos inconvenientes y permite el crecimiento de cristales
mixtos y dopados mediante difusión múltiple.
6
Las propiedades mecánicas de los geles pueden variar ampliamente dependiendo de la densidad
y las condiciones de precisión durante la gelificación. Se ha observado que el tiempo requerido
para la solidificación del gel es muy sensible al pH. Debido a que la solidificación es un proceso
gradual, no existe una única definición del tiempo de gelificación.
Usar un gel como medio de cristalización previene los movimientos mecánicos del sistema de
cristalización, además del aislarlo químicamente, y proporciona estructuras tridimensionales que
permiten que los reactivos se difundan a una velocidad controlada deseada. El gel proporciona
un marco de trabajo de sitios de nucleación siendo suficientemente suave la difusión dentro del
gel, lo cual favorece el crecimiento del cristal.
Sin embargo, tan pronto como el cristal alcanza cierto tamaño, el gel se rompe parcialmente y
forma una o más cavidades. Es interesante tener en cuenta que el cristal no cesa de crecer donde
se producen estas cavidades.
Como observación, se concluye que en ausencia de convección el único mecanismo posible para
suministrar el producto para el crecimiento del cristal es la difusión. En los sistemas de
crecimiento que depende de la difusión de un reactivo a través del gel que incorpora otro reactivo,
se observó que el rango de crecimiento es mejor cerca de la interfaz del gel-disolvente cuando el
gradiente de la concentración es alto y fuera de la interfaz cuando el gradiente de concentración
es relativamente bajo. Esto sugiere que el rango de crecimiento está fuertemente determinado
con los defectos en el cristal incluso en ausencia de impurezas.
7
neutro que se colocará sobre el anterior. Este método se utiliza cuando el medio
ácido puede afectar a los reactivos.
Programando la concentración: inicialmente se parte de una concentración baja y
conocida, a continuación se aumentará la concentración gradualmente. Cuando las
concentraciones son muy bajas, la cantidad de reactivo que difunde a través del gel
es muy pequeña y provoca una supersaturación baja.
Cuando la radiación X atraviesa una muestra, el vector electrónico de la radiación interactúa con
los electrones de los átomos para producir difusión. Cuando los rayos X son difundidos por el
entrono ordenado de un cristal, hay interferencias tanto constructivas como destructivas entre
los rayos dispersados, puesto que las distancias entre los centros de difusión son del mismo orden
que la longitud de onda de la radiación.
La difracción de rayos X se basa en la ley de Bragg, según la cual cuando un haz de rayos X incide
sobre la superficie de un cristal formando un ángulo θ, una posición del haz es difundida por la
capa de átomos de la superficie. La porción no dispersada del haz penetra en la segunda capa de
átomos, donde, de nuevo, una fracción es difundida, y la otra pasa a la siguiente capa, y así
sucesivamente. El efecto acumulativo de esta difusión producida por los átomos con
separaciones regulares del cristal es la difracción del haz. (i) Según la ley de Bragg, el máximo
ángulo al que se puede obtener la difracción corresponde al valor máximo de la función seno (la
unidad), es decir, que la máxima resolución teórica que se puede alcanzar entre átomos es de λ/2.
(ii)
8
2.4.1.1 Método del polvo cristalino
En este método la muestra se pulveriza lo máximo posible de forma que esté constituida por
partículas cristalinas orientadas al azar. Cuando el haz monocromático incide sobre la muestra se
producen al mismo tiempo todas las difracciones posibles. Para cada conjunto de planos
atómicos existen numerosas partículas con una orientación tal que forman un ángulo apropiado
para que se cumpla la ley de Bragg. La desorientación relativa existente entre las partículas que
componen la muestra hace que en los diagramas de difracción quede reflejada, tanto cualitativa
como cuantitativamente, la identificación de las fases cristalinas de la muestra. (11)
9
resolución, un detector de electrones retrodispersados que permite la obtención de imágenes
de composición y topografía de la superficie, y un detector de energía dispersiva EDS permite
recolectar los Rayos X generados por la muestra y realizar diversos análisis semicuantitativos y
de distribución de elementos en superficies.(iii)
2.4.3 Termogravimetría
La definición general de análisis térmico abarca diferentes técnicas en las que se mide una
propiedad física en función de la temperatura mientras es sometida a un programa de
temperaturas controlado. Concretamente la termogravimetría es aquella técnica que mide la
variación de peso de una muestra en función de la temperatura o el tiempo mientras se somete
a un programa de temperaturas en una atmósfera específica.
El programa de temperatura puede mantenerse constante durante todo el proceso (isotermo),
calentarse a velocidad constante, enfriarse o cualquier combinación de ellos. El resultado más
habitual en este tipo de análisis es la pérdida de peso, aunque es posible una ganancia de peso.
La atmosfera puede ser estática o dinámica con un caudal determinado y los gases más habituales
son nitrógeno, aire, argón y dióxido de carbono. (14)
10
3 METODOLOGÍA
3.1.2 Instrumental
Micropipetas y pipetas
Agitador magnético y núcleo magnético
Papel indicador de pH
Balanza electrónica
Microscopio
3.1.3 Reactivos
Metasilicato de sodio
Dihidrógenofosfato de amonio
Sulfato de magnesio heptahidratado
Hidrógenoarseniato de sodio heptahidratado
Ácido clorhídrico
Agua destilada
Figura 5: Difractómetro
Gemini S
Difractómetro de polvo
Se emplea un difractómetro PANalytical X’Pert Pro con radiación de Cu.,
λ = 1.5418 Å. Este difractómetro de polvo permite la identificación y/o
cuantificación de fases cristalinas, análisis microestructural, el estudio
de láminas delgadas, reflectometría, análisis de texturas y tensiones
residuales (Figura 6).
Figura 6: Difractómetro
PANalytical X'Pert Pro
11
Microscopio electrónico de barrido
El microscopio electrónico de barrido con microanális esta
dotado de un cañón de electrones de filamento de
wolframio, con posibilidad de trabajo de 0.5 a 30 kV y una
resolución máxima de 3.0 nm, abarcando de x5 hasta
x50,000 aumentos (Figura 7).
Figura 7: MED JEOL 6610LV
Equipo de termogravimetría con microanálisis
Para los análisis térmicos en atmosfera dinámica de oxígeno
(50 mL/min) se ha utilizado el equipo Mettler-Toledo
TGA/SDTA 851e. La velocidad de calentamiento usada es de
10°C/min. Para el análisis de la muestra se han pesado
aproximadamente 10 mg del compuesto en polvo (Figura 8).
Figura 8: Mettler-Toledo
TGA/SDTA 851e
3.1.5 Software utilizado
Para el tratamiento de los datos obtenidos mediante las distintas técnicas de caracterización
necesitaremos los siguientes programas informáticos:
12
3.2 PREPARACIÓN DEL GEL DE SÍLICE
En primer lugar, se prepara el gel de sílice. Para ello se prepara una disolución al 20%, por lo que
se añaden 10.51 g del metasilicato sódico (disolución muy densa) y 25 mL de agua.
En un vaso de precipitados se añaden la disolución de metasilicato de sodio y las disoluciones
correspondientes en cada ensayo, así como el volumen necesario de ácido cloríhidrico para
ajustar el pH, y se transfiere al tubo de ensayo.
Se deja gelificar durante dos días para conseguir una buena calidad del gel. (26)
13
3.4 CRISTALIZACIÓN CON LA ADICIÓN DE IONES ARSENIATO.
El segundo estudio realizado consiste en una serie de ensayos en los que se varía el pH y la
concentración de iones arseniato. (28)
14
Para poder obtener las imágenes, las muestras se deben recubrir con una capa de oro. A
continuación se introducen en el microscopio, y con una serie de aumentos y niveles de brillo
correctos se busca la mejor resolución posible.
3.5.5 Termogravimetría
Puesto que el tamaño de los cristales obtenidos será relativamente grande, será necesario
triturar la muestra para convertirla en un polvo. Se adiciona una cantidad relativamente pequeña
de muestra sobre una cápsula de platino, aproximadamente 10 mg, y ésta se suspende, mediante
un soporte, quedando finalmente en el interior del horno que a su vez está aislado del exterior
mediante un tubo de vidrio. La propia termobalanza se utiliza para pesar la masa inicial de
muestra.
15
4 RESULTADOS Y DISCUSIÓN
Se puede observar que los cristales crecen en forma ramificada, y que según disminuye el pH
también lo hace el tamaño del cristal, aunque no muy notablemente. Por tanto, el pH debe ser
un factor a tener en a cuenta en cristalización de este compuesto, produciéndose habitualmente
en un rango de 7 a 9.
16
Tabla 3: Cristales obtenidos con una concentración 0.75 M de (NH4) H2PO4
E 1.4 E 1. 5 E 1.6
pH=7 pH=6 pH=3
Al igual que en caso anterior, se puede observar que al disminuir el pH disminuye el tamaño del
cristal; cambiando, aparentemente, incluso la morfología ramificada por cristales de tipo
dendrita en forma de aspa incluso en forma de pluma.
Tabla 4: Cristales obtenido con una concentración 0.5M de (NH4) H2PO4
E 1.7 E 1.8
pH=8 pH= 1
En este ensayo se puede observar que los cristales a un pH neutro están concentrados en una
única zona del tubo de ensayo, concretamente en su fondo. Estos cristales se caracterizan por un
tamaño mayor con respecto a los anteriores. Además, se ha comprobado que la cristalización en
gel de sílice se ha producido incluso a pH ácido, en este caso el número de cristales es abundante
aunque con un tamaño bastante pequeño. Además, la morfología ha variado, obteniéndose
cristales en forma de aguja.
Como visión global del ensayo realizado, se ha podido observar que a mayores concentraciones
de reactivos mayor tamaño de cristales, las morfologías en general son propensas al crecimiento
ramificado, y que el pH afecta al tamaño y/o morfología de los cristales, teniendo lugar la
cristalización incluso a pH ácido.
17
4.1.2 Cristalización con la adición de iones arseniato.
Con respecto al procedimiento experimental, debido a la imposibilidad de poder transferir el gel
de sílice a los tubos de ensayo, se decidió introducir 5 mL de la disolución de silicato, 1.5 mL de
la disolución del dihidrógenofosfato de amonio y 1.5 mL de la disolución de hidrógenoarseniato
de sodio, y ajustar los diferentes pH con ácido clorhídrico. Una vez producida la gelificación, se
introdujeron 1.5 mL de la disolución de sulfato de magnesio.
Transcurridas tres semanas los cristales comienzan a aparecer y se paró la reacción, extrayéndose
cuidadosamente los cristales del gel de sílice con ayuda de un microscopio, de tal manera que se
eliminó la mayor parte posible del gel de sílice.
Tabla 5: Cristales obtenido para una concentracion 0.04 M de Na2HAsO4
E 2.1 E 2.2
pH= 6 pH= 8
La adición de iones arseniato en este ensayo permitió observar que el tamaño de los cristales es
superior, produciéndose incluso un único cristal. Además, fue posible observar que a pH más
básicos el número de cristales aumenta, disminuyendo el tamaño de los mismos.
Tabla 6: Cristales obtenidos para una concentración 0.01 M de Na2HAsO4
18
En comparación con el ensayo anterior, la mayor parte de estos ensayos constan de un único
cristal de grandes dimensiones, excepto el ensayo E 2.2, en el quelos cirstales tienen forma de
aguja, y el ensayo E 2.3, en el que se detectan microcristales con forma de caja. La adicción de
impurezas de arseniato permite que predomine el crecimiento sobre la nucleación; evitando que
se formen múltiples núcleos de crecimiento y, por lo tanto, favoreciendo el crecimiento de un
único cristal.
Figura 9: Unidad asimétrica de la estruvita, en color rojo se muestran los átomos de O, en color
blanco los átomos de H, en color verde el átomo de Mg, en color azul el átomo de N y en color
naranja el átomo de P.
19
Se estudian las distancias y ángulos de enlace, y se comparan con el promedio de los datos
presentes en la base de datos CSD, constatando que son consistentes:
Tabla 7: Comparación de distancias de enlce Mg-O experimentales y teóricas.
20
Finalmente se muestra el empaquetamiento compacto en el cristal para la forma ortorrómbica
del mismo(Figura 11), qu permite observar el eje de simetría de roto-traslacion (21).
21
4.3 MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE BARRIDO Y MICROANÁLISIS
4.3.1 Cristalización en función de la concentración de solventes y el pH
Para la realizacion de la imagen por microscopía electrónica de barrido se ha escogido la muestra
denominada anteriormente como E1.8. La imagen obtenida tiene un aumento de 6,500.
22
4.3.2 Cristalización con la adición de iones arseniato.
Para esta técnica, la muestra escogida para la realizar la microscopía electrónica de barrido es la
denominada E 2.2. En este caso, se obtuvieron dos imágenes con magnificaciones de x100 y x
230 (Figura 14).
Figura 14: Imágenes obtenida por SEM para el ensayo E2.2. con aumentos de
x100 (imagen izquierda) y x230 (imagen derecha)
Para el microanálisis se ha escogido la misma muestra que en la anterior técnica (E2.2). Para este
ensayo, la técnica de microanálisis tiene mayor importancia que en el ensayo anterior, puesto
que cabe la posibilidad de una sustitución parcial del grupo fosfato por el grupo arseniato (Gráfica
2).
23
4.4 DIFRACCIÓN DE RAYOS X EN POLVO
Para realizar esta técnica, una vez comprobado mediante el microanálisis que todos los
compuestos obtenidos corresponden a composición de la estruvita, se han cogido las siguientes
muestras: E 1.4, E 2.1, E 2.4 y E 2.5. Se han comparado los patrones de difracción en polvo; el
generado a partir de la estructura de monocristal y el obtenido experimentalmente (Gráfica 3).
La mayoría de los picos experimentales coinciden con el diagrama de monocristal, por lo que
podemos afirmar que utilizando la técnica de cristalización en geles, se obtiene un material con
elevado grado de pureza.
4.5 TERMOGRAVIMETRÍA
Una vez resuelta la estructura, se somete la muestra a un análisis térmico mediante
termogravimetría. En la gráfica 4 se muestra el termograma (curva TG/DTG y SDTA).
24
Gráfica 4: Termograma obtenido para el compuesto Mg(NH4)PO4·6 H2O
Las curvas TG/DTG muestran una pérdida de masa de 52.50% (en comparación con 54.27%
calculado) en un rango de temperatura de 26°C hasta 1000°C, produciéndose la deshidratación
del compuesto. La pérdida de masa (bajo atmósfera de oxígeno) ocurre en dos pasos
consecutivos entre 25°C y 310°C, alcanzando el máximo de velocidad alrededor de 142°C y 240°C,
correspondiendo con el pico endotérmico a 150°C y 245°C, respectivamente como refleja la curva
SDTA. Además, se observa un pico a 691°C exotérmico que se corresponde con una
transformación de fase.
4.6.3 Termogravimetría
Una vez resuelta la estructura, se somete la muestra a un análisis térmico mediante
termogravimetría. En la gráfica 5 se muestra el termograma (curva TG/DTG y SDTA)
26
Las curvas TG/DTG muestran una pérdida de masa de 58.54% (frente al 60.12% calculado) en un
rango de temperatura desde 26°C hasta 600°C, produciéndose la deshidratación del compuesto.
La pérdida de masa (bajo atmósfera de oxígeno) ocurre en un único paso entre 92°C y 210°C,
alcanzado la máxima velocidad alrededor de 100°C, el cual está asociado con el pico endotérmico
del SDTA. Por espectrometría de masa se confirma la pérdida de agua en este rango. (Gráfica 6)
27
5 CONCLUSIONES
El objetivo principal de este trabajo es obtener cristales de estruvita mediante la técnica de
cristalización en gel y estudiar los efectos que podría tener el cambio de las condiciones tanto del
gel como de los reactivos. Las conclusiones basadas en los resultados y los diversos análisis
realizados son:
28
6 BIBLIOGRAFÍA
30
7 ANEXO 1: DIFRACCIÓN RAYOS X MONOCRISTAL ESTRUVITA
Datos cristalinos y estructurales del refinamiento para gmn16034_estruvita-1-7
Código de identificación Gmn16034_estruvita-1-7
Fórmula Empírica H14NO10MgP
Peso Molecular 243.39
Temperatura/K 293
Sistema Cristalino Ortorrómbico
Grupo Espacial Pmn21
a/Å 6.9414(4)
b/Å 6.1330(3)
c/Å 11.2008(5)
α/° 90
β/° 90
γ/° 90
Volumen/Å 476.84(4)
Z 2
ρcalc g/cm3 1.6950
µ/mm-1 0.389
F(000) 256.5
Radiación Mo Kα (λ=0.71073)
Rango de recolección de datos 2θ/° 6.64-62.6
Rango de índices -10≤h≤9, -8≤k≤8, -15≤l≤16
Reflexiones recolectadas 6544
Reflexiones independientes 1562[Rint=0.0666, Rsigma=0.0530]
Data/restraints/parámetros 1562/0/81
Ajuste del modelo F2 1.048
Índices de R finales [I≥2σ(I)] R1=0.0519, wR2=0.1243
Índices de R finales (todos los datos) R1=0.0681, wR2=0.1383
Densidad eletrónica residual/ eÅ-3 0.84/-0.40
31
8 ANEXO 2: DIFRACCIÓN RAYOS X MONOCRISTAL ESTRUVITA: ARCHIVO
CHECKCIF
En este anexo se incluyen los documentos obtenidos al chequear el CIF de nuestros compuestos
analizados en el apartado 4.2 Difracción rayos X monocristal.
Este chequeo nos permite contrastar la calidad de nuestros datos y los del modelo utilizados.
checkCIF/PLATON report
Structure factors have been supplied for datablock(s) shelx
THIS REPORT IS FOR GUIDANCE ONLY. IF USED AS PART OF A REVIEW PROCEDURE FOR
PUBLICATION, IT SHOULD NOT REPLACE THE EXPERTISE OF AN EXPERIENCED
CRYSTALLOGRAPHIC REFEREE.
No syntax errors found. CIF dictionary Interpreting this report
Datablock: shelx
Bond precision: Mg- O = 0.0045 A Wavelength=0.71073
Cell: a=6.9414(4) b=6.1330(3) c=11.2008(4)
alpha=90 beta=90 gamma=90
Temperature: 293 K
Calculated Reported
Volume 476.84(4) 476.84(4)
Space group P m n 21 P m n 21
Hall group P 2ac -2 P 2ac -2
Moiety formula H10 Mg O6, O4 P, H4 N ?
Sum formula H14 Mg N O10 P H14 Mg N O10 P
Mr 243.40 243.40
Dx,g cm-3 1.695 1.695
Z22
Mu (mm-1) 0.389 0.389
F000 256.0 256.0
F000’ 256.47
h,k,lmax 10,8,16 10,8,16
Nref 1681[ 878] 1562
Tmin,Tmax 0.565,1.000
Tmin’
32
Data completeness= 1.78/0.93 Theta(max)= 31.298
R(reflections)= 0.0519( 1307) wR2(reflections)= 0.1334( 1562)
S = 1.087 Npar= 84
Publication of your CIF in IUCr journals
A basic structural check has been run on your CIF. These basic checks will be run on all CIFs
submitted for publication in IUCr journals (Acta Crystallographica, Journal of Applied
Crystallography, Journal of Synchrotron Radiation); however, if you intend to submit to Acta
Crystallographica Section C or E or IUCrData, you should make sure that full publication checks
are run on the final version of your CIF prior to submission.
Publication of your CIF in other journals
Please refer to the Notes for Authors of the relevant journal for any special instructions relating
to CIF submission.
PLATON version of 30/03/2016; check.def file version of 30/03/2016
Datablock shelx - ellipsoid plot
33
9 ANEXO 3: DIFRACCIÓN RAYOS X MONOCRISTAL FOSFATO DE MAGNESIO.
Datos cristalinos y estructurales del refinamiento para gmn16034_estruvita-ppd
Código de identificación Gmn16034_estruvita-ppd
Fórmula Empírica H44O26Mg3P
Peso Molecular 564.25
Temperatura/K 295.6(5)
Sistema Cristalino Triclínico
Grupo Espacial P-1
a/Å 6.9313(4)
b/Å 6.9417(5)
c/Å 16.171(2)
α/° 90.296(8)
β/° 97.793(8)
γ/° 119.485(7)
Volumen/Å 668.70(11)
Z 1
ρcalc g/cm3 1.401
µ/mm-1 0.266
F(000) 303.0
Radiación Mo Kα (λ=0.71073)
Rango de recolección de datos 2θ/° 6.766-62.986
Rango de índices -10≤h≤9, -9≤k≤9, -22≤l≤22
Reflexiones recolectadas 10376
Reflexiones independientes 3978 [Rint=0.0633, Rsigma=0.1088]
Data/restraints/parámetros 3978/0/175
Ajuste del modelo F2 1.249
Índices de R finales [I≥2σ(I)] R1=0.0926, wR2=0.2350
Índices de R finales (todos los datos) R1=0.1473, wR2=0.2688
Densidad eletrónica residual/ eÅ-3 0.61/-0.56
34
10 ANEXO 4: DIFRACCIÓN RAYOS X MONOCRISTAL FOSFATO DE MAGNESIO.
CHECKCIF
En este anexo se incluyen los documentos obtenidos al chequear el CIF de nuestros compuestos
analizados en el apartado 4.5.2. Difracción Rayos X monocristal.
Este chequeo nos permite contrastar la calidad de nuestros datos y los del modelo utilizados.
checkCIF/PLATON report
Structure factors have been supplied for datablock(s) shelx
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PUBLICATION, IT SHOULD NOT REPLACE THE EXPERTISE OF AN EXPERIENCED
CRYSTALLOGRAPHIC REFEREE.
No syntax errors found. CIF dictionary Interpreting this report
Datablock: shelx
Bond precision: Mg- O = 0.0047 A Wavelength=0.71073
Cell: a=6.9313(4) b=6.9417(5) c=16.171(2)
alpha=90.297(8) beta=97.793(8) gamma=119.485(7)
Temperature: 293 K
Calculated Reported
Volume 668.70(12) 668.70(12)
Space group P -1 P -1
Hall group -P 1 -P 1
Moiety formula 3(H12 Mg O6), 2(H3 O4 P), 3(H12 Mg O6), 2(H3 O4 P),
4(H2 O) 4(H2 O)
Sum formula H50 Mg3 O30 P2 H50 Mg3 O30 P2
Mr 665.27 665.27
Dx,g cm-3 1.652 1.652
Z 1 1
Mu (mm-1) 0.347 0.347
F000 356.0 356.0
F000’ 356.61
h,k,lmax 10,10,23 10,10,23
Nref 4439 4439
Tmin,Tmax 0.966,0.978 0.674,0.773
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Tmin’ 0.959
Correction method= # Reported T Limits: Tmin=0.674 Tmax=0.773
AbsCorr = MULTI-SCAN
Data completeness= 1.000 Theta(max)= 31.490
R(reflections)= 0.0914( 2459) wR2(reflections)= 0.2384( 3978)
S = 1.106 Npar= 175
Publication of your CIF in IUCr journals
A basic structural check has been run on your CIF. These basic checks will be run on all CIFs
submitted for publication in IUCr journals (Acta Crystallographica, Journal of Applied
Crystallography, Journal of Synchrotron Radiation); however, if you intend to submit to Acta
Crystallographica Section C or E or IUCrData, you should make sure that full publication checks
are run on the final version of your CIF prior to submission.
Publication of your CIF in other journals
Please refer to the Notes for Authors of the relevant journal for any special instructions relating
to CIF submission.
PLATON version of 06/05/2016; check.def file version of 05/05/2016
Datablock shelx - ellipsoid plot
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