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Tema 9: Genética cuantitativa 1

Puntos principales a tratar:


•¿Qué es la variación fenotípica cuantitativa?

•Naturaleza de la variación continua

•Poligenes y loci de caracteres cuantitativos

•Métodos estadísticos para la descripción de la variación continua

•Heredabilidad y familiaridad

•Componentes genético y ambiental de la varianza fenotípica de una


carácter cuantitativo

•Heredabilidad en sentido amplio y restringido

•Herencia cuantitativa en el hombre: la frontera de la genética en el


siglo XXI
Tema 9: Genética cuantitativa 2
Variación fenotípica cuantitativa

Tema 9: Genética cuantitativa 3


¿Qué es la variación fenotípica cuantitativa?
•Cualquier carácter fenotípico (morfológico, fisiológico, conductual) que
toma distintos valores cuantificables en diferentes individuos y no
sigue una patrón de herencia mendeliana simple es un carácter
cuantitativo

•Variación continua (altura, peso, temperamento, C.I., tasa metabólica,


producción lechera,...)
•Variación discreta (número de quetas o facetas en Drosophila, vértebras
en serpientes, bandas en caracoles, plumas en aves, escamas en peces...)

•Para describir su variación se utilizan métodos estadísticos tales com


la media y la varianza

•Son caracteres de gran importancia


•Agrícola y ganadera
•Médica y social

El estudio de la herencia de estos caracteres son


el objeto de la Genética Cuantitativa
Tema 9: Genética cuantitativa 4
Variación cuantitativa vs mendeliana (o cualitativa)

Distribución de la altura de varones adultos de


Boston
Caracteres cualitativos mendelianos

Tema 9: Genética cuantitativa 5


Variación cuantitativa:
continua o discreta

Carácter cuantitativo continuo Caracteres cuantitativos discreto


Tema 9: Genética cuantitativa 6
Variación mendeliana vs cuantitativa
Planta guisante Maíz
Enanas X altas Cortas X largas
Frecuencia

Altura planta Longitud de la mazorca


Frecuencia

F1
F1 X F1 =
Altas X altas F1 X F1

Altura planta Longitud de la mazorca


Frecuencia

Altas 3/4
Gama completa
F2
Enanas 1/4

Altura planta Tema 9: Genética cuantitativa Longitud de la mazorca


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La disputa histórica entre Biométricos vs mendelianos
•Darwin (1859) y Mendel (1865 -> 1900)

•Se creyó por mucho tiempo que los caracteres cuantitativos y los
mendelianos obedecen a leyes distintas. ¿Cuál era la naturaleza de la
variación importante para la evolución? Biométricos (caracteres
cuantitativos) y mendelianos (caracteres cualitativos).

•1918: Sir Ronald Fisher integra el mendelismo con la biometría.


Demuestra que la variación cuantitativa es una consecuencia natural de la
herencia mendeliana.

Tema 9: Genética cuantitativa 11


•Experimento Nilsson-Ehle (1909) cruzó dos variedades de trigo puras que
diferían en el color de los granos de trigo, rojo y blanco. La F1 era intermedia
en color y al cruzarla entre sí obtuvo al menos 7 clases de color en la F2.
¿Cómo explicarlo?

Rojo X Blanco
Hipótesis más simple
P AA aa
Supongamos control del
carácter por un gen con Color intermedio
dos alelos sin
dominancia F1 Aa

Rojo : Intermedio : Blanco


F2 AA Aa aa

1: 2: 1

Tema 9: Genética cuantitativa 12


Supongamos control del carácter por dos genes idénticos
con dos alelos cada uno, sin dominancia, y donde la
intensidad del color rojo depende del número de alelos
mayúsculas (que son los que producen el pigmento rojo)
P
Rojo X Blanco
AABB aabb
F1
Color intermedio (Rojo medio)
AaBb
F2
Rojo oscuro: Rojo medio oscuro : Rojo medio : Rojo claro : Blanco
AABB AaBB AaBb Aabb aabb
AABb AAbb aaBb
aaBB
1 : 4 : 6 : 4 : 1
Tema 9: Genética cuantitativa 13
Mismo supuesto anterior pero con tres genes

Rojo X Blanco
P AABBCC aabbcc
F1 Color intermedio X Color intermedio (autofecundación)
AaBbCc AaBbCc
•Fenotipo
F2
Rojo ------------------------> Blanco
•Número alelos que dan color

6:5: 4: 3: 2 :1:0

•Proporción

1 : 6 : 15 : 20 : 15 : 6 : 1

Supuestos: los genes segregan


independientemente y sus
efectos son aditivos Tema 9: Genética cuantitativa 14
Un par de genes Tres clases fenotípicas
(A1 A2 X A1 A2 )

Dos pares de genes Cinco clases fenotípicas


(A1 A2 B1 B2 X A1 A2 B1 B2 )

Tres pares de genes Siete clases fenotípicas

Cinco pares de genes Once clases fenotípicas

Diez pares de genes 21 clases fenotípicas:


desde el genotipo con ningún alelo
+ hasta el genotipo con los 20
alelos +
Con variación ambiental
Rojo Blanco
o caso límite
Color
Tema 9: Genética cuantitativa 15
Modelo de poligenes o loci cuantitativos:

el valor que toma un carácter cuantitativo en un genotipo depende del número


de genes de efecto pequeño (poligenes) que añaden valores + al carácter.
Así, en un carácter determinado por 5 loci cuantitativos (poligenes) los
genotipos irán de 10 alelos más a 10 alelos 0

+++++ +++++ 00000


+++++ 00000 00000

Ejemplos:

Dos genes con dos alelos cada uno (A a y B b) y con acción aditiva de
modo que A o B añade 2 unidades en promedio al valor del carácter. Hay
cinco clases fenotípicas en proporciones 1:4:6:4:1

Si el genotipo aabb tiene una valor fenotípico de 10 unidades, entonces,


el genotipo AaBb = 14 unidades fenotípicas y el genotipo AABB = 18.
Tema 9: Genética cuantitativa 17
Generalización del modelo aditivo
1 locus 2 loci 3 loci n loci
2 4 8 2n
Gametos distintos producidos (A,a) (AB, Ab, aB, ab) (ABC,Abc,...
por el multihíbrido en la F1 ...,abc)

Número de genotipos distintos


en la F2 3 9 27 3n
(AA,Aa,aa) (AABB, AABb, (AABBCC,...
Aabb,AaBb,...
...,aabb) ...,aabbcc)
Número de fenotipos distintos en
la F2 3 5 7 2n+1

Proporción de la F2 con un fenotipo


extremo como el de una de
las líneas parentales 1/4 1/16 1/64 1/4n
(AA ó aa) (AABB ó aabb) (AABBCC ó aabbcc)
Proporción fenotípica de la F2
1:2:1 1:4:6:4:1 1:6:15:20:15:6:1 (1A+1a)2n
Tema 9: Genética cuantitativa 18
La distribución aproximadamente normal de muchos
caracteres cuantitativos puede fundamentarse en el
teorema central del límite, que dice que la
distribución de la suma aleatoria de muchos
pequeños efectos se aproxima asintóticamente a
una distribución normal, “a singularly beautiful law”
(F. Galton).

Tema 9: Genética cuantitativa 19


Galton’s apparatus (Galton’s Quincunx)
Demostración intuitiva
del Teorema Central
del Límite

Cuando una bola topa


con un palito tiene una
probabilidad ½ de ir
hacia la derecha o hacia
la izquierda (sería
análogo a la
segregación de uno u
otro alelo en un gen
heterocigoto. Así cada
palito que se encuentra
la bola al caer es un gen
cuantitativo que segrega
con igual probabilidad
hacia un alelo (+) ó (-)).

Ver animación
aquí

Tema 9: Genética cuantitativa 20


AABBCC aabbcc
P
F1
AaBbCc

F2

Frecuencia en %

20

15 15

6 6
1 1
Tema 9: Genética cuantitativa 21
Distribución de la altura de varones adultos de Boston
Tema 9: Genética cuantitativa 23
La distribución normal
Dos parámetros determinan la forma de la
distribución:
1 x 2
•la media,  y 1  ( )
f ( x)  e 2 
•la desviación típica  (raíz cuadrada de  2
la varianza 2 = [(x-)2]/n) Función de densidad

•A y B difieren en sus medias (4 y


8)
•B y C difieren en sus desviaciones
típicas (1 y 0,5)

http://www.evotutor.org/
Statistics/St1A.html

Tema 9: Genética cuantitativa 24


Muestreo de una distribución normal

Tema 9: Genética cuantitativa 25


Relación entre dos variables cuantitativas: correlación

Longitud de cola y el
cuerpo de 18 individuos
de la serpiente
Longitud del 1er y 2o
Lampropeltis polyzona
molar inferior de un
mamífero extinto

Número de escalas caudales y longitud de la cola en las ( x  x )( y  y )


mismas 18 serpientes de arriba rx , y  Correl ( x, y )  
n
Cov( x, y )
var( x) var( y ) http://www.evotutor.org
/Statistics/St2A.html

Tema 9: Genética cuantitativa 26


Heredabilidad de un carácter
Distribución
fenotípica
de la población
aa Aa AA en su conjunto

Maa MAA Valor fenotípico


MAa

•Si distintos genotipos de una población presentan distintas


distribuciones para un carácter, decimos que el carácter es
heredable

Tema 9: Genética cuantitativa 27


Experimentos de selección artificial para la determinación de
la heredabilidad de un carácter cuantitativo

Generación
parental

Media
Cruce entre
individuos con
valores Heredable
fenotípicos
extremos (mismo
ambiente)

No heredable

Tema 9: Genética cuantitativa 28


Componente genético y ambiental de la
heredabilidad de un carácter

El valor fenotípico de un carácter en un


individuo de la población depende de su
genotipo y de su ambiente aa Aa AA

z: valor fenotípico de un individuo


g: efecto medio del genotipo
Maa MAA
e: efecto del ambiente MAa

z=g+e

Varianza fenotípica en la población:


Var (z) = Var (g + e) = Var (g) + Var (e) + 2 Cov (g,e)
Si 2 Cov (g,e) = 0 (se pueden conseguir experimentalmente), entonces
Var (z) = Var (g) + Var (e)
ó
 2z =  2g +  2e
Tema 9: Genética cuantitativa 29
Definiciones de heredabilidad para un carácter cuantitativo

•Heredabilidad en sentido amplio

H2 = Var (g) / Var (z) = 2g / 2z 0  H2  1

•Heredabilidad en sentido restringido


x: efecto medio del genotipo
a: efecto aditivo de los alelos que forman el genotipo
d: efecto no aditivo (o dominante) de los alelos que forman el genotipo

g=a+d
0  h2  1
h2 = Var (a) / Var (z) = 2a / 2z
h2  H2
Tema 9: Genética cuantitativa 30
Métodos de estimación (medida) de la heredabilidad en
poblaciones experimentales

•Respuesta a la selección artifical

Experimento de selección para aumentar o


disminuir la longitud del ala en diversas
poblaciones de Drosophia subobscura.
(Datos de Prevosti 1967)

Antoni Prevosti
Tema 9: Genética cuantitativa 31
Respuesta a la selección artifical

h2r = heredabilidad realizada


y = Media fenotípica en la
población parental
y0 = Media fenotípica en la
descendencia
yp = Media fenotípica de los
individuos seleccionados

Y0 - Y
h2r = =
Yp - Y

Respuesta

Diferencial
de selección
Tema 9: Genética cuantitativa 32
Heredabilidad en humanos
•Distribución de la F2 de cruzamientos
que se dan de forma natural
•Ejemplo, color de la piel

Picture: Jodie Andrews Source: News Limited

•Estudio de gemelos
•Limitaciones:
•Muestras pequeñas
•Aleatoriedad ambiente
(ambiente intrauterino
común,...)

•Estudio de adopciones

Tema 9: Genética cuantitativa 33


Concordancia de caracteres en estudios de gemelos

Gemelos idénticos Gemelos fraternos


(monocigóticos) (dicigóticos)

Color del pelo 89 22


Color de los ojos 99,6 28
Presión sanguínea 63 36
Lateralidad 79 77
(diestro o zurdo)
Sarampión 95 7
Pie zambo 23 2
Tuberculosis 53 22
Cáncer de mama 6 3
Esquizofrenia 80 13
Síndrome de Down 89 7
Espina bífida 72 33
Psicosis maniaco- 80 20
depresiva

Tema 9: Genética cuantitativa 34


Estimas de heredabilidad (H2) en algunos caracteres y transtornos humanos

Carácter Heredabilidad
Esquizofrenia 0,85

Diabetes mellitus
Aparición temprana 0,35
Aparición tardía 0,70
Asma 0,80

Labio leporino 0,76

Cardiopatía (congénita) 0,35

Úlcera péptica 0,37

Depresión 0,45

Estatura 1,00

Tema 9: Genética cuantitativa 35


Estudios de asociación a escala genómica
Genome Wide Association (GWA) Studies
Base de datos de la diversidad
genética y fenotípica en humanos

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Espacio genotípico y fenotípico

Tema 9: Genética cuantitativa 37


Links de interés

 Introduction to Quantitative Genetics


 Recursos de Genética cuantitiva - Quantitative
Genetics Resources
 Quincunx (simulación)
 El teorema central del límite en acción
 Genome Wide Association (GWA) Studies

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