У 2009 році спільнота розробників Ubuntu вирішила об'єднати та централізувати систему управління пакунками. Починаючи з версії Ubuntu 9.10 Software Center замінив 5 раніше використовуваних програм. Починаючи з версії 3.0 до Software Center додана можливість купування платних застосунків і можливість встановлення deb пакунків через інтерфейс програми.